Além do financiamento principal que fornece a todos os think tanks participantes, o Thinkonomics pode fornecer uma fonte adicional de financiamento para projetos inovadores e colaborativos.
Os Fundos de oportunidade (anteriormente denominados Fundos de Correspondência) destinam-se a apoiar a aprendizagem e a colaboração entre pares. A ênfase também é colocada na promoção da propriedade sobre os resultados – como resultado, a maioria dos projetos do Fundo Oportunidade é financiada em parte pelos próprios think tanks. Os projetos financiados através do Fundos de Oportunidade destinam-se a ajudar os think tanks a alcançar os seus objetivos a longo prazo e a realizar iniciativas que vão além daquelas financiadas através dos seus principais subsídios.